Фамилия Знайденко — одна из тех, где корень виден невооружённым глазом, но этимология ставит в тупик. Основа — «знайд-», что по-украински и в южнорусских говорах означает «найденный». Глагол «знайти» (найти) дал прозвище Найден, а потом и фамилию с суффиксом -енко. Всё просто, если не вглядываться в детали.

Суффикс -енко — типичный украинский патронимический формант, указывающий на потомка. Значит, Знайденко — это «сын Найдёна» или «потомок того, кого нашли». Прозвище Найден обычно давали подкидышу или ребёнку, которого родители нашли, а не родили. В крестьянской среде, где каждый ребёнок был работником, найдёнышей брали охотно, но социальный статус такого человека был особым — он не имел корней в роду, и прозвище закреплялось навсегда.

Интересно, что фамилия Знайденко почти не встречается в центральной России, но широко бытует на Украине, особенно в Полтавской, Черкасской и Сумской областях. Там же находится и село Знайденка в Харьковской области — топоним, который мог повлиять на распространение фамилии. Не исключено, что часть носителей получила фамилию не от прозвища, а от названия населённого пункта.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Найденов, Найденко, Найдёнышев) показывает, что Знайденко — более редкий вариант. В русской среде прижилась форма через «а» (Найденов), а украинская форма с «и» (Знайденко) вытеснила её на юго-западе. Встречается и написание через «е» — Знаеденко, но это уже диалектное колебание.

Таким образом, предки современных Знайденко с высокой вероятностью были выходцами из Левобережной Украины, а сама фамилия рассказывает историю о подкидыше, которого приютили и дали ему род. Никаких дворянских корней, никаких «знатных» предков — обычная крестьянская фамилия, в которой сохранился бытовой эпизод из жизни XVII–XVIII веков.