Фамилия Зодун — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычных русских суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу выдаёт нерусскую или искусственную основу. Скорее всего, перед нами фамилия-прозвище, застывшая в начальной форме, как это иногда бывает у украинских, белорусских или южнославянских фамилий.

Корень «зод-» в славянских языках связан со строительством и созиданием. Глагол «здать» (старославянское «зьдати») означал «строить, возводить». Отсюда «зодчий» — архитектор, строитель. Логично предположить, что прозвище Зодун дали человеку, который занимался строительным делом: каменщику, плотнику или руководителю работ. Суффикс -ун в русских и украинских говорах часто образует названия лиц по действию: бегун, говорун, крикун. Зодун в этом ряду — «тот, кто строит», «строитель».

Вторая версия — искусственное происхождение. В советское время при смене фамилий или в среде старообрядцев могли образовать фамилию от церковнославянского корня, чтобы подчеркнуть трудолюбие или связь с ремеслом. Такие фамилии встречаются единично и не имеют географического кластера.

Фамилия Зодун почти не фиксируется в исторических документах и современных справочниках. Это значит, что она либо очень локальна (одна-две семьи), либо была изменена в прошлом веке. Если ваши предки носили эту фамилию, стоит искать их в регионах с сильным влиянием украинского или белорусского языка — на западе России, в Черниговской или Гродненской губерниях, где суффикс -ун особенно распространён.

Сравните с однокоренными, но более частыми фамилиями: Зодчий, Зодчиков. У них та же строительная основа, но суффикс другой. Зодун стоит особняком: он короче, звучит как прозвище, а не как фамилия на -ов. Это может говорить о том, что фамилия закрепилась в форме, близкой к исходному прозвищу, без позднейшей русификации.