Фамилия Зоидбоев — редкая, и её разбор требует внимания к необычной основе. В русской ономастике практически нет фамилий, образованных от такого корня, что сразу указывает на иноязычное происхождение, скорее всего, из языков Средней Азии или Кавказа. Модель образования здесь — русский суффикс принадлежности -ев, который добавляется к основе восточного личного имени или прозвища. В данном случае основа — Зоидбой (или Зоидбек), где «бой» (тюркское «бай» — «господин, богатый, хозяин») — распространённый компонент имён, а «Зоид» — имя арабского корня, возможно, вариант имени Заид (Заид — «растущий, прибавляющийся»). Таким образом, Зоидбой — это «господин по имени Зоид» или «Зоид-богатырь».

Фамилия образована по типичной для XIX–XX веков модели русификации: к восточному имени добавляли русский патронимический суффикс, чтобы закрепить фамилию в документах Российской империи или СССР. Носители фамилии Зоидбоев — почти наверняка потомки человека по имени Зоидбой, который жил в регионе с сильным тюркским или таджикским влиянием (Узбекистан, Таджикистан, юг Кыргызстана). В этих местах имена с компонентом «бой» были особенно популярны в XVIII–XIX веках, а фамилии на -ев стали массово фиксироваться при советской паспортизации 1920–1930-х годов.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Зоидов, Зоидбеков) показывает, что вариант Зоидбоев — самый конкретный: он прямо указывает на имя отца, а не на род или место. В отличие от фамилий на -ский, которые часто давались по географическому признаку, Зоидбоев — чисто патронимическая фамилия, без территориальной привязки. Это значит, что предки носителя не были дворянами или духовенством, а происходили из крестьянской или ремесленной среды, где имя отца служило главным идентификатором семьи.

Если копнуть глубже, то вторая часть — «бой» — в тюркских языках могла означать не только «богатый», но и «сильный», «вожак». В сочетании с арабским именем Зоид (которое также встречается у народов, исповедующих ислам) получается значение «растущий господин» или «приумножающий богатство». Впрочем, в быту имя Зоидбой, скорее всего, давали мальчику в надежде на его будущий достаток и авторитет, а фамилия уже просто закрепила это пожелание как родовое имя.