Фамилия Зомер — это не русская, а немецкая фамилия, попавшая в Россию вместе с переселенцами, колонистами или специалистами, приглашёнными на службу. В исконно русской среде она не образовывалась, поэтому искать в ней славянские суффиксы -ов или -ин бессмысленно. Её нужно разбирать по законам немецкой ономастики.

Основа фамилии — немецкое слово «Sommer», что значит «лето». В Германии это одна из самых распространённых «календарных» фамилий, наряду с Winter, Frühling, Herbst. Человек по прозвищу Зомер, скорее всего, не имел отношения к времени года напрямую. Чаще всего так называли крестьянина, который платил оброк или отрабатывал барщину именно летом (в отличие от «зимних» работников), или же человека с весёлым, «солнечным» нравом. Вторая версия — топонимическая: фамилию мог получить выходец из населённого пункта с названием Sommer (например, Sommerfeld или Sommerhausen).

В России фамилия закрепилась в двух написаниях: через букву «о» — Зомер, и через «а» — Замер. Второй вариант — результат адаптации немецкого звучания к русской фонетике, где безударная «о» редуцируется в «а». Встречается она в основном в Поволжье, где существовали крупные немецкие колонии, а также в Санкт-Петербурге и Москве — в среде обрусевших немцев на военной или гражданской службе. Дворянских корней у фамилии в России нет, если только конкретный носитель не был пожалован титулом лично — в таком случае это единичная история, а не массовое явление.

С точки зрения словообразования, Зомер — «чистая» фамилия без суффиксов, типичная для немецкой модели, когда прозвище или название профессии переходило в наследственное имя без изменений. Сравните с русскими аналогами: Летов или Летников — они тоже образованы от слова «лето», но с помощью типичных для восточных славян суффиксов принадлежности. Разница в подходах наглядная: русские добавляли -ов/-ев, немцы оставляли основу как есть.