Фамилия Зубайрина почти наверняка женская — это форма женского рода от фамилии Зубайрин. Мужской вариант, Зубайрин, встречается редко, и его происхождение неочевидно. Самое правдоподобное объяснение — тюркское или кавказское имя в основе.

Разберём суффикс. Окончание -ин — типичный русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность: «чей?» — Зубайрин, то есть сын или потомок Зубайры. Но здесь загвоздка: в славянских именах корня «зубайр» нет. Поэтому основу фамилии нужно искать за пределами русской ономастики.

Скорее всего, Зубайрин восходит к мужскому личному имени Зубайр (араб. Зубайр, от корня «зубр» — сила, мощь). Имя распространено у мусульманских народов — татар, башкир, чеченцев, ингушей, народов Дагестана. В русской среде такое имя адаптировали, добавив суффикс -ин, чтобы получить фамилию по модели «чей сын»: Зубайр + ин = Зубайрин. Женская форма Зубайрина, соответственно, означает «жена или дочь Зубайрина».

Есть и менее вероятная версия: от прозвища Зубайра, которое могло возникнуть на русской почве из слова «зуб» с экспрессивным суффиксом -айр (по аналогии с «кривляка» или «задира»). Такие прозвища давали драчунам или людям с заметными зубами. Но эта гипотеза слабая: суффикс -айр нехарактерен для русских прозвищ, а в тюркских языках он встречается часто.

Географически фамилия Зубайрина тяготеет к регионам с мусульманским населением — Татарстану, Башкортостану, Северному Кавказу. В центральных русских областях она почти не встречается, что тоже подтверждает восточное происхождение основы.

Таким образом, предок современного носителя фамилии Зубайрин, скорее всего, носил имя Зубайр. В какой-то момент, при переходе на русскую систему фамилий (обычно в XIX — начале XX века), к этому имени добавили русский суффикс -ин — так и закрепилась фамилия.