Фамилия Зуптаров — редкая и её корень сразу бросается в глаза: он явно не славянский. Основа «Зуптар» с большой вероятностью восходит к арабскому или персидскому слову, связанному с понятием «сила», «мощь» или «победа». В исламской ономастике известен эпитет «аз-Захир» (победоносный, явный), и фамилия могла возникнуть от его диалектного или тюркизированного варианта. Суффикс «-ов» — стандартный русский патронимический формант, указывающий на принадлежность: «сын Зуптара». Таким образом, Зуптаров — это русифицированная фамилия, которую дали потомкам человека с прозвищем или именем Зуптар.

Альтернативная, менее вероятная версия связывает фамилию с тюркским корнем «зуп» (острый, колющий) и аффиксом «-тар», обозначающим деятеля. В этом случае Зуптар — «тот, кто колет» или «острый человек», то есть прозвище мастера по обработке металла или, в переносном смысле, острого на язык человека. Однако первая версия — арабское происхождение через исламскую традицию — выглядит убедительнее, так как такие фамилии чаще встречаются у народов, принявших ислам (татары, башкиры, народы Кавказа). Географически Зуптаровы, скорее всего, распространены в Поволжье, на Урале или в Средней Азии — регионах, где смешивались славянские и тюрко-мусульманские антропонимические модели.

Словообразовательная модель проста: к основе «Зуптар» добавили русский суффикс принадлежности «-ов». В дореволюционной России так оформляли фамилии крестьянам и мещанам из нерусских народов, когда их вносили в ревизские сказки или метрические книги. Никаких дворянских приставок, двойных корней или редких суффиксов вроде «-ский» здесь нет — фамилия однозначно указывает на непривилегированное происхождение, скорее всего, на крестьянское или мещанское сословие. Написание устойчивое, без вариантов, что говорит о поздней фиксации (XIX век), когда орфография уже устоялась.