Фамилия Зюганова — женская форма фамилии Зюганов, и её происхождение неоднозначно, но почти все версии сходятся на прозвище Зюган. Самая прямая версия — тюркская. В татарском языке «зюган» означает часть конской сбруи, надеваемую на голову лошади. Отсюда логичный вывод: предок носительницы фамилии мог заниматься коневодством, быть кучером или извозчиком. Прозвище по роду занятий — одна из самых частых моделей образования русских фамилий, так что эта гипотеза выглядит рабочей.

Вторая группа версий ведёт прозвище от славянских корней, а именно от глагола «зюкать» (или его диалектного варианта «зюгать»). Тут важно, что значения у этого слова различались в зависимости от губернии. В Калужской — «болтать, беседовать», в Курской — «шептаться, говорить в мыслях», а в псковских говорах — «бить, колотить, стучать». Если прозвище образовано от первого значения, то предка могли считать болтуном или, наоборот, скрытным человеком, привыкшим шептаться. Если от второго — Зюганом могли прозвать строителя, дровосека, кузнеца, то есть того, кто работает молотом или топором. В курских говорах «зюкать» означало ещё и «пить вино» (отсюда «назюкаться» — напиться), но в этом значении чаще использовали форму «Зюзя» или «Зюля», так что эта версия менее вероятна.

Есть и совсем редкая гипотеза: от слова «зюганка» — названия сорта пшеницы. Тогда прозвище мог получить крестьянин, который выращивал или продавал именно этот сорт. Точных данных о сословной принадлежности носителей фамилии Зюганов нет, но, судя по семантике прозвищ, предки скорее всего были крестьянами или ремесленниками.