Фамилия Зюлюганова — женская форма от Зюлюганов, и её разговорный характер сразу заметен по суффиксу. Основа фамилии — прозвище Зюлюган, а в нём, скорее всего, скрывается тюркский корень. Если мысленно убрать суффикс -ов, остаётся Зюлюган — слово, которое в русских говорах или в языках Поволжья могло означать человека с определённой внешностью или манерой поведения. Вероятнее всего, в основе лежит тюркское «зюлюк» — рябой, веснушчатый, или близкое к нему слово с корнем «зюль» (плохой, дрянной). Тогда Зюлюганом называли либо человека с рябым лицом, либо, в переносном смысле, нерадивого или непутевого.

Модель образования типична для русских фамилий XVI–XVII веков: личное прозвище плюс патронимический суффикс -ов. Суффикс -ан- в середине слова (Зюлюг-ан) — характерный для русских прозвищ уменьшительно-оценочный элемент, как в словах «гуляка» или «злыдень». То есть Зюлюган — это не просто «рябой», а «рябой малый» или даже «рябой парень», со слегкой простонародной окраской.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где издавна смешивались русское и тюркское население: Поволжье, Приуралье, южные области. Встречается она нечасто, что говорит о её локальном происхождении — скорее всего, от одного прозвищного гнезда в какой-то конкретной деревне или слободе. В архивных записях фамилию стоит искать в метрических книгах бывших Казанской, Симбирской или Оренбургской губерний.

Интересно, что в фамилии нет ни дворянского суффикса -ский, ни типично крестьянского -их/-ых. Это стандартная фамилия служилых людей или государственных крестьян, которые получали фамилию по отцу-прозвищу. Никакого отношения к знатным родам Зюлюгановы не имеют — их история начинается с простого человека, которого за глаза называли рябым или невезучим, а потом это прозвище закрепилось за его потомками.