Фамилия Зюкуев — один из тех редких случаев, когда за основу взято не имя и не профессия, а, скорее всего, прозвище, связанное с диалектной лексикой. В её основе лежит слово «зюк» или «зюка», которое в русских говорах, особенно северных и уральских, имеет несколько значений. Чаще всего «зюкать» означало «звенеть, бренчать, издавать резкий звук», а «зюк» — это либо сам такой звук, либо прозвище говорливого, надоедливого человека. В других диалектах «зюк» могли называть неповоротливого, неуклюжего человека. Точное значение сегодня восстановить сложно, но ясно, что прозвище было ярким и звукоподражательным.

Суффикс -ев указывает на русскую модель образования фамилий от основ на мягкий согласный или -й. В данном случае основа «Зюкуй» (с суффиксом -уй, который в русских прозвищах часто придавал оттенок пренебрежения или шутливости) дала форму «Зюкуев» — то есть «сын Зюкуя». Такая модель типична для XVI–XVII веков, когда фамилии активно закреплялись за крестьянами и посадскими людьми.

Географически фамилия Зюкуев тяготеет к северным и центральным областям России. Встречается она нечасто, что говорит о её локальном происхождении, возможно, из одного села или волости. В дореволюционных метрических книгах носители фамилии зафиксированы в Вятской и Пермской губерниях — регионах, где диалектная лексика особенно богата звукоподражательными прозвищами.

Версия о тюркском происхождении (от тюркского имени или слова) маловероятна: фамилия имеет чёткую русскую словообразовательную структуру с суффиксом -уй и окончанием -ев, а в тюркских языках подобные формы нехарактерны. Если бы корень был заимствован, он бы, скорее всего, оформился через суффикс -ов (например, Зюков).

Таким образом, предок носителя фамилии Зюкуев — человек с прозвищем Зюкуй, которое дали либо за голосистость и болтливость, либо за неуклюжесть. Фамилия сохранила редкую диалектную основу, не перешедшую в литературный язык, и сегодня служит своеобразным лингвистическим артефактом.