Фамилия Зюнькин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Зюнькин послужило церковное имя Зиновий. Фамилия Зюнькин происходит от имени Зюнька. Вероятно, оно является производной формой от имени Зиновий, которое произошло от древнегреческого слова zenobeus, что означает «Зевс» и «биос», т.е. Вероятно, основатель рода Зюнькиных был выходцем из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Зюнька, со временем получил фамилию Зюнькин. О точном месте и времени возникновения фамилии Зюнькин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Зюнькин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.