Фамилия Зюнькин происходит от имени Зюнька. Вероятно, оно является производной формой от имени Зиновий, которое произошло от древнегреческого слова zenobeus, что означает «Зевс» и «биос», т.е. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Зюнька, со временем получил фамилию Зюнькин.