Фамилия Зюзюнов образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов, указывающим на принадлежность: Зюзюн → сын Зюзюна. Но её ядро — прозвище Зюзюн — звучит необычно и заставляет искать корни в диалектах или старых русских говорах.

Самое вероятное объяснение ведёт к слову «зюзя» или «зюзюка». В северных и центральных говорах «зюзей» называли человека, который вечно мёрзнет, кутается, или просто неряху, неопрятного. В словаре Даля «зюзя» — это «мокрый, вымокший до нитки», а также «грязный, нечистоплотный». Глагол «зюзюкать» означал невнятно говорить, шепелявить. Так что Зюзюн — это скорее прозвище по внешности или поведению: либо вечно замёрзший и промокший, либо неразборчиво бормочущий человек. Суффикс -ун в прозвищах (сравните: говорун, бегун) активен и часто несёт оттенок свойства или привычки.

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным словом «зюзька» — так в некоторых местах называли свинью или поросёнка. В этом случае прозвище могло быть шутливым или даже обидным. Третья версия — от имени Зюзя, которое могло быть уменьшительной формой от канонического имени Зосима (через Зосим → Зозя → Зюзя). Но для фамилии Зюзюнов эта гипотеза слабее: прозвищная модель с -ун выглядит убедительнее, чем патронимическая от редкой формы.

Географически фамилия редкая, встречается в основном в центральной России и Поволжье, что косвенно подтверждает её прозвищную природу — такие «говорящие» прозвища чаще закреплялись в крестьянской среде, где внешность или привычка человека становились его вторым именем. Никакой связи с дворянством или известными историческими родами у Зюзюновых нет: это поздняя крестьянская или мещанская фамилия, закреплённая после отмены крепостного права.

Таким образом, предок носителя фамилии Зюзюнов — скорее всего, человек, получивший яркое бытовое прозвище за привычку мёрзнуть, неопрятность или невнятную речь. В фамилии сохранилась живая деталь народного языка, которую сегодня уже не услышишь в городе.