Фамилия Абалонышева — редкий случай, когда основа неочевидна даже для специалиста. В ней нет привычного корня от крестильного имени или названия профессии, поэтому разбирать её стоит через суффикс и возможные диалектные прозвища.

Ключ к пониманию — суффикс -ышев. В русских фамилиях он встречается нечасто и обычно указывает на происхождение от прозвища с уменьшительно-ласкательным или уничижительным оттенком. Форма Абалонышев (женский вариант — Абалонышева) образована от мужского прозвища Абалон или Абалоня с помощью суффикса -ыш, который дал основу Абалон-ыш, а затем фамильный суффикс -ев. То есть предка могли звать Абалоном, а его сына или внука — уже Абалонышевым.

Что же такое «Абалон»? Самая вероятная версия — искажённое диалектное «обалонь», «оболонь». В говорах северных и центральных областей России (особенно в рязанских, владимирских, ярославских) «оболонь» или «обалонь» — это заливной луг, пойма, низина у реки. Человек, живший на таком лугу или владевший им, мог получить прозвище Обалон или Абалон. Устойчивое аканье (произношение «а» вместо «о») в безударной позиции закрепило форму «Абалон». Таким образом, Абалонышев — потомок того, кто жил «на оболони», то есть на пойменном лугу.

Вторая версия, менее убедительная, связывает фамилию с личным именем Аполлон. В народном произношении это имя могло редуцироваться до Абалона. Однако для фамилии на -ышев такая основа маловероятна: от имени Аполлон обычно образовывали Аполлонов или Аполлонский, а уменьшительные формы (Аполлоша, Аполя) дали бы иные суффиксы. Версию с Аполлоном можно отбросить как натянутую.

Географически фамилия редкая и локальная. В современных базах данных Абалонышевы встречаются единично, преимущественно в Центральной России и Поволжье — как раз в зоне распространения слова «оболонь». Ни о каком дворянском или крестьянском сословии говорить не приходится: перед нами типичная «географическая» фамилия, возникшая в крестьянской или мещанской среде по месту жительства. Судьба рода — обычная для русской глубинки: от прозвища к фамилии, от деревни к городу.