Фамилия Абатаев образована от имени Абатай, которое восходит к персидскому имени Абат. Имя Абат в свою очередь образовано от персидского слова «абад» со значением «цветущий, благоустроенный». Суффикс –ай, при помощи которого образована фамилия Абатаев, в тюркских языках имеет уменьшительно-ласкательное значение. Также слово «ай» в древнетюркском языке означало «месяц». Таким образом, потомок человека, которого звали Абатай, со временем получил фамилию Абатаев.