Фамилия Аберкова — женская форма, её мужской вариант — Аберков. Основа фамилии неочевидна на первый взгляд, но укладывается в несколько типичных для русских фамилий моделей. Самое простое объяснение: в основе лежит личное имя или прозвище Аберк, Аберко. Такое имя могло возникнуть как вариант крестильного имени Аверкий (через народное Аверко с заменой «в» на «б» — явление, обычное в диалектной речи, ср. «Абрам» из «Авраам»). Аверкий — имя греческого происхождения, в святцах означающее «удерживающий, удаляющий», но в народной среде оно быстро потеряло связь с исходным значением.

Менее вероятная, но возможная версия — происхождение от прозвища, связанного с диалектным словом «аберка» или «оберка». В некоторых говорах так называли непоседу, вертлявого человека, либо того, кто постоянно «оборачивается», оглядывается. В этом случае фамилия образована по той же модели, что и Вертиков, Крутиков, — от глагола со значением движения.

Суффикс -ов- в фамилии Аберков указывает на типичную русскую патронимическую модель: «чей?» — сын Аберка. Таких фамилий много в среде крестьян и мещан центральных и северных губерний России. Фамилия редкая, нечастотная, что говорит о её локальном бытовании — скорее всего, в одной или нескольких соседних областях. Встречается она преимущественно в Поволжье и на Урале, где переселенцы несли с собой прозвищные формы имён.

Интересная деталь: написание через «е» (Аберкова, а не Оберкова) закрепилось, вероятно, под влиянием письменной фиксации в церковных метриках, где писарь записывал имя на слух, не задумываясь о диалектной акающей норме. Поэтому носителям фамилии стоит искать своих предков именно по варианту с «а» в корне.