Фамилия Адылходжаев образована по простой, но показательной модели: к полной форме составного восточного имени Адылходжа приращивают русский патронимический суффикс -ев. Этот суффикс указывает на принадлежность — «сын Адылходжи», — и именно так в период Российской империи при переписях и составлении метрик адаптировали местные имена под русскую форму фамилий. Подобное словообразование характерно для народов Средней Азии и Кавказа, где к сложному имени добавляли типично русское окончание.

Само имя Адылходжа состоит из двух компонентов. Первый — «адыл» — восходит к арабскому ‘ādil, что значит «справедливый» или «правосудный». Второй — «ходжа» — персидское khwāja, которое переводится как «господин», «хозяин» или «наставник». В Средней Азии «ходжа» также обозначало потомка пророка или духовное лицо высокого ранга. Таким образом, имя Адылходжа буквально означает «справедливый господин» или «праведный наставник».

Географически фамилия почти наверняка связана с Узбекистаном, Таджикистаном или южными регионами Кыргызстана, где имя Адылходжа встречается среди узбеков и таджиков. В России она редка и обычно принадлежит выходцам из этих республик. В отличие от фамилий на -ов, которые могли образовываться от прозвищ и профессий, здесь основа — личное имя, и это сразу указывает на социальный контекст: предок носителя, скорее всего, был человеком уважаемым, возможно, из духовенства или купечества, раз его назвали «ходжой».

В некоторых тюркских языках форма «адыл» может сливаться с диалектным произношением, но смысл остаётся тем же. Фамилия не имеет ничего общего с русским словом «адыл» (которого не существует) — это чисто арабский корень. Если сравнивать с однокоренными фамилиями (Адылов, Адылбаев), то Адылходжаев занимает отдельную нишу: компонент «ходжа» придаёт ей оттенок религиозного или сословного статуса, которого нет в более простых формах.