Фамилия Афиркина — женская форма фамилии Афиркин. Её основа, скорее всего, восходит к мужскому имени Афирка. У этого имени есть несколько версий происхождения, и ни одна не является абсолютно бесспорной.

Самая прямая версия связывает имя Афирка с библейским названием страны Офир, которая славилась золотом и драгоценностями. В этом случае имя могло символизировать богатство или быть прозвищем человека, связанного с торговлей или ремёслами. Менее вероятно, но возможно, что в основе лежит перевод еврейского слова «офир» — «серый», то есть прозвище по цвету волос или одежды.

Другая версия выводит Афирку из просторечной формы канонического имени Аверкий. Аверкий происходит от латинского глагола «averto» — «обращать в бегство». Такое имя могли дать в надежде, что мальчик вырастет победителем. Однако есть и третье предположение: Аверка могло быть искажением имени Валериан (от лат. «valeo» — «быть здоровым, сильным»). В народе эти имена иногда путали, сокращая и переделывая на свой лад.

Какая из версий верна для конкретной семьи Афиркиных, сказать трудно. Ясно одно: фамилия образована по типичной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Афиркин, то есть сын или потомок человека по прозвищу или имени Афирка. Где именно возникла эта фамилия — в еврейской или русской среде, — зависит от того, какое имя считать исходным. Если корень библейский, то фамилия могла появиться у евреев, живших на территории Российской империи. Если же в основе лежит народная форма Аверкий или Валериан, то это чисто русская фамилия, распространённая среди крестьян и мещан.