Фамилия Агалиева — женская форма, а её основа — мужская фамилия Агалиев, которая образована от личного имени Агали. В русской традиции фамилии на -ев/-ов образуются от имён и прозвищ, оканчивающихся на согласный или -й, и здесь мы видим именно этот случай: Агали + ев.

Корень имени — Агали — имеет тюркское происхождение. В тюркских языках «ага» означает «старший», «господин», «почтенный человек», а «ли» — аффикс обладания, то есть Агали буквально переводится как «имеющий старшего», «почтенный» или «принадлежащий к старшим». Это имя было распространено у народов Поволжья, Кавказа и Средней Азии, особенно среди татар, башкир, кумыков. Встречается и у ногайцев, и у казахов в форме Агалы или Агали.

По модели образования фамилия Агалиев/Агалиева — типичная для русификации тюркских имен: к основе добавили русский патронимический суффикс -ев, который указывал на принадлежность к роду. То есть предок носителя фамилии, по всей видимости, носил имя Агали, а его потомков стали записывать как «сын Агали» — Агалиев. В метрических книгах и ревизских сказках XIX века такие фамилии часто фиксировались у крещёных татар и башкир, а также у мусульман, принявших русское подданство.

Географически фамилия Агалиева чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане, Астраханской области и в Дагестане. Встречается и в Казахстане, но там написание может варьироваться — Агалиев или Агалыев. Интересно, что в некоторых случаях фамилию могли записать с ошибкой: вместо Агалиев — Агалеев, так как звук «и» в безударной позиции на слух воспринимался как «е».

Таким образом, фамилия Агалиева — это не просто «фамилия от имени», а маркер тюркского происхождения, указывающий на то, что предок был уважаемым человеком (ага) или старшим в роду.