Фамилия Агалиевы (в мужском роде — Агалиев) образована от составного тюркского имени Агали. Первая часть, «ага», означает «господин», «старший», «хозяин». Вторая, «али», восходит к арабскому «али» — «возвышенный», «высокий». Имя Агали, таким образом, можно перевести как «великий господин» или «возвышенный владыка». Нарекая сына Агали, родители желали ему стать знатным, уважаемым и влиятельным человеком.

Фамилии на -ев от тюркских имен — обычное дело в среде, где сталкивались русская и тюркская культуры. Суффикс -ев указывает на принадлежность: Агалиев значит «сын Агали», «потомок Агали». Такая модель словообразования закрепилась в русской фамильной системе, когда имя отца превращалось в фамилию детей.

Корни фамилии уходят в XV–XVII века, в эпоху активных контактов Русского государства с тюркскими народами — выходцами из Золотой Орды, с печенегами и половцами. Многие служилые люди, татарские и ногайские мурзы, переходили на русскую службу, принимали православие, но сохраняли свои имена, которые затем становились фамилиями. Именно в этой среде и могла возникнуть фамилия Агалиев.

Фамилия эта — не единичная. В русском ономастиконе есть и другие фамилии с основой «ага»: Агаев, Агаларов, Агафонов (от греческого Агафон, но здесь иная этимология). Агалиев стоит в ряду таких именований, как Алиев, Ахмедов, Усманов — все они восходят к арабским или тюркским именам и указывают на восточные корни рода.

Географически фамилия Агалиевы встречается в регионах с традиционно сильным тюркским влиянием: в Поволжье (Татарстан, Башкортостан), на Северном Кавказе, в Закавказье, а также среди астраханских и крымских татар. Встречается она и у азербайджанцев, и у туркмен, и у кумыков — везде, где имя Агали было в ходу.

Фамилия Агалиев — не дворянская в привычном русском смысле. Среди носителей этой фамилии были и крестьяне, и ремесленники, и купцы, и военные. Но сам факт, что фамилия образована от имени со значением «господин», говорит о высоком статусе родоначальника — пусть и не в российской табели о рангах, а в своей, тюркской среде.