Фамилия Агамурадов — тюркская по происхождению, образованная от личного имени Агамурад. Разбираем имя на части: «ага» в тюркских языках значит «господин», «старший», «почтенный человек» (ср. турецкое ağa, узбекское ota — «отец» в почтительном смысле). Вторая часть — «мурад» — арабское слово, означающее «желание», «цель», «намерение»; в мусульманском именослове это одно из популярных имён, восходящее к арабскому Мурад (желанный, вожделенный). Таким образом, Агамурад — это составное имя вроде «почтенный Мурад» или «старший, чья цель достойна уважения».

Суффикс -ов в фамилии — русский патронимический формант, который в XIX–XX веках добавляли к тюркским именам при русификации документов (переписи, паспорта, воинский учёт). Фамилия Агамурадов, следовательно, означает «потомок Агамурада». Модель образования типична для народов Средней Азии: туркмен, узбеков, каракалпаков. В самой Туркмении фамилия Агамурадов встречается часто, особенно среди туркменского племени теке (ахалтекинцы) и ёмудов.

Географически основная масса носителей — Туркменистан, Узбекистан (особенно Хорезмская область и Каракалпакстан), а также юг Казахстана. В России фамилия редкая, появлялась у выходцев из Средней Азии, переехавших в советское время. Поскольку имя Агамурад — не аристократическое, а скорее народное, предки носителя фамилии скорее всего были ремесленниками, скотоводами или мелкими торговцами, а не знатью.

В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках фамилию могли записывать по-разному: Агамурадов, Ага-Мурадов, Агамурад-оглы (с тюркским окончанием). Советская паспортизация закрепила единый вариант. Интересная деталь: в туркменском языке ударение в фамилии падает на последний слог — АгамурадОв, что отличает её от русских фамилий с ударением на «а» (АгАмурадов).