Фамилия Агавпкин — редкий случай, когда с первого взгляда понятно, что перед нами не исконно русская основа, а переделанное на русский лад иноязычное имя. Вопреки возможной догадке, корень здесь не связан с «агавой» или чем-то растительным. В основе фамилии лежит армянское мужское имя Агавп, что является формой библейского имени Агав (один из раннехристианских пророков, упомянутый в Деяниях апостолов). Прибавление русского патронимического суффикса -ин дало фамилию Агавпкин, то есть «потомок Агавпа».

Словообразовательная модель проста: к основе Агавп- добавили типичный русский суффикс принадлежности -ин, который указывает на родство по отцу. Так образовывались фамилии от прозвищ и имён, оканчивающихся на согласный или -а/-я (сравните: Ильин, Пушкин, Бородин). В данном случае суффикс прирос к армянскому имени, что говорит о глубоком культурном контакте: носитель фамилии — потомок армянина, который обрусел, и его дети уже получили фамилию по русскому образцу.

Географически фамилия Агавпкин тяготеет к южным регионам России и Северному Кавказу, а также к местам исторического расселения армянских общин (Краснодарский край, Ставрополье, Ростовская область). Встречается она крайне редко — это штучная, локальная фамилия, не разошедшаяся широко по стране.

Происхождение фамилии не оставляет простора для альтернативных версий: попытки вывести её из тюркских или кавказских языков безосновательны, так как имя Агавп чётко фиксируется в армянских святцах. Таким образом, Агавпкин — яркий пример того, как чужое имя, пройдя через русскую фамильную «машину», стало звучать по-домашнему, по-русски, сохранив при этом память о древнем библейском корне.