Фамилия Агней — редкая и сбивающая с толку. Первое, что приходит в голову: не греческая ли это основа, не от «агнец» ли, то есть «ягненок»? Но нет, ничего общего. В русском контексте эта фамилия почти наверняка имеет искусственное, семинарское происхождение. Так в XVIII–XIX веках давали фамилии выпускникам духовных училищ и семинарий, часто — по церковным праздникам, именам святых или просто по красивым латинским и греческим словам.

В основе лежит латинское agnus — «ягненок». Но не просто ягненок, а прямое отсылка к «Агнец Божий» (Agnus Dei) — одному из главных символов Христа в христианстве. Фамилия Агней — это русифицированная форма от латинского прилагательного agneus («агнчий», «относящийся к агнцу») или прямая транслитерация слова Agnus с добавлением типичного русского окончания -ей (как Андрей, Матвей, но в данном случае — от латинской основы). Семинаристам, бравшим себе такую фамилию, она должна была напоминать о кротости, жертвенности и чистоте.

Модель образования здесь нетипична для крестьянских или дворянских фамилий. Суффикса -ов/-ин нет, что сразу выдает книжное, а не бытовое происхождение. Фамилия не «приросла» к роду из прозвища, а была дана или выбрана самим человеком при поступлении в духовное сословие. Поэтому и географическая привязка у неё слабая: носители Агней рассеяны по всей России, но с заметным тяготением к бывшим губернским городам, где были духовные семинарии (например, к Рязани, Твери, Владимиру).

В некоторых говорах фамилию могли переосмыслить на свой лад, сблизив с диалектным «агнец» или даже с «огонь» (через аканье: Агней — Огней), но это уже вторичное народное переосмысление, не имеющее отношения к первоначальному замыслу. По сути, Агней — это фамилия-символ, и её носитель, скорее всего, потомок либо священнослужителя, либо человека, получившего образование в духовной среде.