Фамилия Агов — редкий случай, когда короткая форма не упрощает, а, наоборот, ставит перед выбором: откуда пошел род? В отличие от типичных русских фамилий на -ов, которые образуются от притяжательного прилагательного (чей? — Иванов, Петров), здесь мы имеем дело с усеченной основой. Суффикс -ов присоединен к корню «аг», который в русском языке самостоятельного значения не имеет. Значит, искать нужно в прозвищах или именах.

Самая вероятная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках «аг» (ağ) означает «белый», «чистый», «благородный». Это могло быть прозвище светловолосого человека, либо именование, подчеркивающее знатность или «белую кость». В османской и кавказской среде слово «ага» (ağa) — это господин, хозяин, старший. Фамилия Агов могла возникнуть в среде крещеных татар, башкир или народов Кавказа, где тюркские элементы в ономастиконе — обычное дело. Форма на -ов указывает на обрусение: предка звали Аг (или Ага), а его потомки стали Аговыми.

Менее вероятная, но возможная версия — от календарного имени Аггей (др.-евр. «праздничный»). В народном произношении имя нередко утрачивало сдвоенную согласную и звучало как Агей. От него образовалась бы фамилия Агеев, но в случае с Аговым могла сыграть роль диалектная замена суффикса или запись фамилии на слух, без строгой книжной нормы. Однако это объяснение слабее, так как для имени Аггей существует устойчивая модель Агеев, и отсечение «е» в основе — редкость.

Географически фамилия Агов встречается в основном на Северном Кавказе, в Поволжье и в южных регионах России. Это косвенно подтверждает тюркскую версию: именно в этих местах исторически сильны тюркские и кавказские влияния. Носители фамилии могли быть выходцами из служилых татар, казаков или горских народов, принявших православие. Единичные случаи в центральной России, скорее всего, результат поздних миграций.

С точки зрения словообразования фамилия проста: основа «Аг» + патронимический суффикс «-ов». Это означает «сын (или потомок) Ага». Социальный статус предка, если верна тюркская версия, мог быть достаточно высоким — «ага» в традиционном обществе обозначало не просто хозяина, а уважаемого, состоятельного человека, часто землевладельца или военного.