Фамилия Агопов — одна из тех, что на первый взгляд кажется простой, но при ближайшем рассмотрении открывает историю миграций и языковых контактов. Её основа — армянское имя Агоп, которое представляет собой народную, обиходную форму канонического имени Акоп (армянский вариант библейского Иаков). Имя Иаков переводится с древнееврейского как «второй по рождению» или «держащийся за пяту», а в армянской среде оно стало одним из самых распространённых крестильных имён.

Модель образования фамилии — типично русская, с суффиксом -ов, который в данном случае выполняет функцию притяжательности: «чей?» — Агопов, то есть «из рода Агопа», «сын Агопа». Такая адаптация армянских фамилий с помощью русских патронимических суффиксов массово происходила в XIX — начале XX века, особенно после вхождения Восточной Армении в состав Российской империи. Примечательно, что в самом армянском языке фамилии от имени Акоп образуются иначе — с помощью суффиксов -ян/-янц (Акопян, Акопянц). Форма Агопов — это результат русской канцелярской переработки, когда фамилию записывали «на слух» и оформляли по привычной модели.

География фамилии разорванная и неожиданная. В дореволюционных и советских документах Агоповы встречаются не только на Кавказе, но и в Казахстане (аул Сарайский, Западно-Казахстанская область), а также в Средней Азии (Таджикистан, посёлок Джиликуль). Это объясняется не столько армянским происхождением, сколько тем, что фамилию могли получить представители других народов — например, казахи или татары, — если их предка звали Агоп или он носил прозвище, связанное с армянским именем. В таких случаях фамилия не указывает на этническую принадлежность, а лишь фиксирует имя родоначальника или его прозвище.

Важно различать написание: фамилия Агопов (с буквой «г») — это та самая «обрусевшая» форма, а исконно армянская фамилия от того же имени — Акопов (с «к»). Оба варианта существуют параллельно, и их носители не всегда знают, что по сути это одна и та же родовая основа, прошедшая разную фонетическую обработку.