Фамилия Агушина — женская форма, образованная от мужской основы Агушин с помощью суффикса -а. В русской традиции такие фамилии указывали на принадлежность к роду: «жена Агушина» или «дочь Агушина». Чтобы понять её корни, разбираем мужской вариант.

В основе фамилии лежит, скорее всего, неканоническое имя или прозвище Агуша. Это уменьшительная форма от крестильных имён Агапий (от греческого «агапэ» — любовь) или Агафон (от «агатос» — добрый, хороший). В народной среде такие имена усекали до коротких, ласковых вариантов, особенно в быту. Суффикс -ш- в имени Агуша типичен для северо-западных и центральных областей России — сравните с Тимошей, Матюшей.

Менее вероятная версия связывает Агушу с диалектным словом «агу» или «агукать»: так в некоторых говорах называли младенца, который ещё не умеет говорить, или ласково обращались к ребёнку. В этом случае прозвище могло закрепиться за взрослым из-за детской черты характера или поведения.

Фамилия Агушин (и Агушина) довольно редкая, без выраженной географической привязки к одному региону — встречается разрозненно. По социальному составу это, скорее всего, крестьянская или мещанская фамилия: в дворянской и духовной среде такие «домашние» имена-основы фиксировались реже. Модель на -ин продуктивна в русском языке и указывает на принадлежность к конкретному лицу (чей? — Агушин). Это типичный случай, когда фамилия возникла из отчества или дедичества, то есть по имени прямого предка.