Фамилия Аколупин — редкая и неочевидная. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать слово по частям и отбросить современные ассоциации.

Основа фамилии — «Аколуп». Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: «чей?» — Аколупин, то есть сын или потомок Аколупа. В русских фамилиях этот суффикс обычно крепится к основам, оканчивающимся на -а, -я, или к прозвищам, именам, названиям профессий.

Самое правдоподобное объяснение корня «Аколуп» — диалектное или искажённое прозвище. В северных и сибирских говорах слово «колупать» означало ковырять, долбить, с трудом отделять что-то от поверхности. «Аколуп» могло быть прозвищем медлительного, кропотливого человека, который «колупается» — делает всё медленно и въедливо. Приставка «а-» в русских прозвищах иногда появлялась как результат стяжения или народной этимологии (сравните с фамилиями типа Акулов — от «акула», хотя исходно могло быть иначе).

Вторая версия, менее вероятная, но возможная — связь с греческим именем Аколуф (Ακόλουθος), что значит «спутник», «последователь», «слуга». В православных святцах есть мученик Аколуф, но имя это было крайне редким на Руси. Если бы фамилия пошла от него, мы ждали бы форму Аколуфов или Аколутов. Форма «Аколупин» с твёрдым «п» скорее указывает на русскую, бытовую, а не книжную основу.

Географически фамилия тяготеет к центральной России и Поволжью, но встречается единично. В дореволюционных переписях и метрических книгах её почти нет — это говорит о том, что носителей было мало и род, скорее всего, крестьянский или мещанский. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Таким образом, Аколупин — фамилия-прозвище, образованная от слова «колупать» с приставкой. Предок носителя получил кличку за свой неторопливый, дотошный характер или за то, что занимался какой-то «ковырятельной» работой — например, резьбой по дереву, долблением камня или просто был нерасторопным человеком. Прямых однокоренных фамилий в русском языке почти нет, что делает Аколупиных уникальным, локальным явлением в русской антропонимии.