Фамилия Акшибаева — женская форма, указывающая на мужской вариант Акшибаев. Её строят по типичной русской модели с суффиксом принадлежности -ев, который присоединяют к основам на согласный. В основе лежит прозвище или некалендарное имя Акшибай.

Корень составной: «ак» и «шибай». Первая часть восходит к тюркскому «ак» — «белый», «чистый», «светлый», «благородный». Вторая часть — «шибай» — более спорна. Вероятнее всего, это вариант тюркского слова «шибан» в значении «удар», «битва», «воин». Тогда имя Акшибай могло означать «белый воин» или «светлый боец» — типичное для кочевых народов имя-пожелание мальчику быть удачливым в бою и чистым помыслами.

Менее убедительна версия, связывающая «шибай» с диалектным русским глаголом «шибать» (бить, ударять). Хотя фамилия имеет русское окончание, тюркская основа здесь значительно правдоподобнее: прозвища с компонентом «ак» широко распространены у башкир, татар, казахов и других тюркоязычных народов Поволжья и Урала. Именно этот регион — основная зона бытования фамилии Акшибаев/Акшибаева.

Словообразовательная модель типична для фамилий, возникших в XVI–XIX веках среди крещёных или обрусевших тюркских народов. Суффикс -ев указывает на то, что родоначальника звали Акшибай, а его потомки стали Акшибаевыми. Сословная принадлежность могла быть разной: от рядовых общинников до служилых людей, но точных данных о социальном статусе первых носителей нет. Фамилия редкая, в списках столбового дворянства не встречается, что указывает на её происхождение из крестьянской или казачьей среды.