Фамилия Актаукенова образована от мужской формы Актаукенов, а та — от тюркского имени Актаукен. Это составное имя, где первая часть «ак» переводится как «белый», «чистый», «благородный», а вторая — «таукен» (или «тауке») восходит к казахскому «тауке» — «петух». В тюркской ономастике имя Петух не было редкостью: его давали мальчикам как оберег от сглаза или как знак бойцовского характера, звонкого голоса. Сочетание «Ак-» с таким именем могло означать «белый (чистый, светлый) петух» — метафора человека заметного, гордого, но без агрессии.

Суффикс «-ов» указывает на русскую модель оформления фамилии: так в XIX–XX веках записывали фамилии казахов, башкир, татар и других народов Российской империи при переходе к паспортной системе. Окончание «-а» в Актаукенова — женский вариант, но сама фамилия закрепилась в роду как наследственная.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам Казахстана, а также к Оренбургской области России, где исторически жили казахи Младшего и Среднего жузов. Встречается и в форме Актаукенов — без «а» на конце для мужчин.

Редкость фамилии в том, что основа «таукен» почти не фиксируется в современных казахских именах: она устарела, вытесненная арабскими и персидскими заимствованиями. Поэтому Актаукенова — один из немногих следов, сохранивших старое тюркское именование, которое в XIX веке могло звучать естественно, а сегодня воспринимается как уникальное.