Фамилия Акварова звучит необычно для русского уха — в ней сразу слышна латинская основа. «Аква» (aqua) переводится как «вода». Но как латинское слово оказалось в русской фамилии? Прямой связи с античностью тут нет, скорее всего, перед нами искусственное или семинарское образование.

Самая вероятная версия: фамилия дана в духовной семинарии. В XVIII–XIX веках будущим священникам нередко меняли бытовые русские фамилии на более благозвучные, книжные, часто с латинскими или греческими корнями. Исходной могла быть фамилия Водяной, Водкин, Водовозов или даже просто прозвище Вода. Семинарское начальство переводило основу на латынь и добавляло типичный фамильный суффикс -ов, получая Акваров. Женская форма Акварова закрепилась за дочерьми и жёнами таких выпускников.

Суффикс -ов указывает на принадлежность: буквально «из рода Акварова», то есть потомок того, кого прозвали или назвали Акваром. Мужской вариант — Акваров — тоже существует, но менее распространён. В русской ономастике фамилии на -ов — самые массовые, но с такой редкой основой их единицы.

Вторая, менее правдоподобная версия — связь с тюркскими языками. В некоторых тюркских наречиях есть слово «ак» (белый) и «вар» (есть, имеется), но сложить их в осмысленное прозвище, которое дало бы фамилию, трудно. К тому же суффикс -ов типичен для русификации, а не для тюркской модели. Поэтому семинарское происхождение остаётся основным.

Географически фамилия Акварова встречается редко, в основном в центральной России и Поволжье — там, где были сильные духовные училища. Носителей мало, и в дореволюционных метрических книгах она почти не попадается, что подтверждает её позднее, книжное возникновение. По сословной принадлежности предки почти наверняка были из духовенства, реже — из разночинцев, получивших фамилию при поступлении в училище.