Фамилия Алаханов — редкая и неоднозначная по происхождению. Её основа, «Алахан», может быть как тюркским именем, так и арабским религиозным прозвищем, поэтому разбирать её стоит с двух сторон.

Первый и наиболее вероятный путь — тюркский. В языках народов Кавказа и Средней Азии «Ала» часто означает «пёстрый», «рябой» или «пятнистый». В сочетании с «хан» (титул правителя или почётное обращение) имя Алахан могло означать «пёстрый хан» — не в прямом смысле, а как прозвище человека с приметной внешностью, например, веснушками или сединой. Такие составные имена с титулом были распространены у кумыков, ногайцев и других тюркских народов: Алихан, Солтанхан, Асланхан. Суффикс «-ов» в фамилии указывает на русскую патронимическую модель, которой часто оформляли фамилии горцев при переписях XIX века.

Вторая версия — арабская. «Аллах» (Бог) в произношении некоторых диалектов может редуцироваться до «Ала». Тогда «Алахан» — это стяжение от «Абдуллах» (раб Аллаха) или «Ала-хан» (хан от Бога). Однако эта гипотеза слабее: в классической арабской ономастике форма «Алахан» не встречается, а тюркская модель с титулом «хан» и бытовым прилагательным куда привычнее для степных и горских культур.

Географически фамилия Алаханов чаще всего встречается у чеченцев, ингушей и кумыков. В Чечне есть даже село Алахан-Кала, что косвенно подтверждает древность имени в регионе. Предки современных Алахановых, скорее всего, были не знатными ханами, а уважаемыми старейшинами или воинами, получившими прозвище за внешнюю приметность или связь с местным правителем.

С точки зрения словообразования, фамилия проста: корень «алахан» и стандартный русский суффикс принадлежности «-ов». В дореволюционных записях могла писаться через «ъ» — Алахановъ. Родственных фамилий по корню много: Алаев, Алашев, Алакаев — все они уходят в тюркское «ала» и различаются лишь вторым компонентом или суффиксом.