Фамилия Алдакимова — женская форма мужской фамилии Алдакимов, а её основа, редкое прозвище или имя Алдаким, почти забыта. В русской традиции фамилии на -ов/-ев образовывались от крестильных или мирских имён, реже — от прозвищ по профессии или внешности. Здесь же мы имеем дело с гибридной моделью: тюркский корень получил типичный русский суффикс.

Скорее всего, в основе лежит тюркское имя Алдаким (или Алдакем). В тюркских языках «алда» означает «обманывай, хитри», а суффикс «-кым» может придавать значение «мой обманщик» или «мой хитрец». В прошлом такие имена давали детям с обережной целью: считалось, что злые духи не позарятся на ребёнка с «плохим» или несерьёзным именем. Имя должно было ввести в заблуждение потусторонние силы, сделать мальчика незаметным для них. Это типичная практика для многих народов Поволжья, Кавказа и Сибири.

Другая, менее вероятная версия — связь с диалектным русским словом «алдак» (западный говор), означающим «обманщик, плут». Но в этом случае фамилия звучала бы как Алдаков, а не Алдакимов. Удлинённая форма с «-им» скорее указывает на иноязычный корень, который при заимствовании в русский язык получил суффикс -ов. Именно вставка «-им» отличает эту фамилию от более простых однокоренных вариантов и выдает её тюркское происхождение: в русском языке не было продуктивной модели, порождающей такие основы.

Географически фамилия встречается в регионах с сильным тюркским субстратом: в Оренбургской, Самарской областях, в Татарстане и Башкортостане. Там, в зоне многовекового соседства славян и тюрков, такие гибридные фамилии были обычным делом. Предок носительницы фамилии Алдакимова, скорее всего, был русским или обрусевшим человеком, носившим тюркское прозвище Алдаким. По роду занятий — крестьянин или служилый человек, фамилия не указывает на дворянское или купеческое происхождение.