Фамилия Алексеишина стоит в ряду редких русских фамилий, образованных не по самому распространённому пути. Вместо привычного суффикса -ов (как в Алексеев) или -ин (Алексеин) здесь использован суффикс -ишин, который указывает на принадлежность через форму имени на -иша.

В основе лежит имя Алексей. Уменьшительно-ласкательная форма Алексеиша (с ударением на второй слог) — не самая частая, но вполне возможная в северных и центральных говорах, где имена часто «растягивали» дополнительными слогами. Суффикс -ишин в русских фамилиях обычно закреплялся за теми, кого называли по отцу или по прозвищу: на вопрос «чей ты?» отвечали «Алексеишин», то есть сын или потомок того, кого в семье или деревне звали Алексеишей.

Именно суффикс -ишин, а не более частотный -ов или -ин, и определяет редкость фамилии. Он образует так называемые «полуотчества» — форму, которая в крестьянской среде закреплялась за домашним, бытовым именем отца. То есть предок носительницы фамилии был не просто Алексеем, а именно Алексеишей — так его звали в быту. В словообразовательном ряду фамилия стоит рядом с такими же редкими формами, как Иванишин, Петришин, Степанишин.

Фамилия Алексеишина (женская форма) и Алексеишин (мужская) не получили массового распространения. В отличие от Алексеева, которая встречается повсеместно, эта форма осталась локальной. По данным современных справочников, носители фамилии встречаются в основном в Поволжье и на Урале — регионах, где долго сохранялись старые диалектные формы имён. Сословная принадлежность здесь не прослеживается: такие фамилии встречались и у крестьян, и у мещан. Главная ценность фамилии в том, что она сохранила редкую языковую форму, которая почти исчезла из живого употребления.