Фамилия Алексюн — нечастая, но её происхождение прозрачно. Она образована от крестильного имени Алексей, которое пришло на Русь из Византии вместе с христианством. Древнегреческое «Алексий» переводится как «оберегающий», «защитник». В основе фамилии лежит не полная форма имени, а его уменьшительно-ласкательный вариант — Алексюн. Такие формы в народе давали детям или близким, а позже закреплялись за целым родом.

Суффикс «-юн» в русских фамилиях встречается редко, но он хорошо известен в украинской и белорусской ономастике. Сравните: Андрюн, Васкюн, Грицюн. Это указывает на то, что фамилия Алексюн, скорее всего, сформировалась на западнорусских землях — в нынешней Беларуси, на западе Украины или в приграничных областях России. Там такие суффиксы были обычны для образования прозвищ и фамилий от личных имён.

Поскольку фамилия образована от народной, а не от канонической формы имени, можно предположить, что её носители происходили из простого сословия. В крестьянской и мещанской среде полные имена часто заменяли домашними вариантами, которые потом становились фамилиями. Дворянские роды чаще фиксировали фамилии от полных имён или по названиям поместий.

Если взглянуть на словообразовательную модель, фамилия Алексюн стоит в ряду с такими же, как Алексюк, Алексеенко, Алексанов — все они восходят к одному корню, но различаются суффиксами, характерными для разных регионов. «-Юн» — один из самых редких, что делает фамилию локально узнаваемой.

Встречается она и сегодня, но в основном в Беларуси, на Украине и среди потомков выходцев оттуда в России. В дореволюционных метрических книгах фамилия фиксировалась в Могилёвской, Гродненской и Киевской губерниях. Никаких сведений о принадлежности к знатным родам или выдающихся исторических личностях с этой фамилией нет — перед нами типичная фамилия, родившаяся из домашнего имени, которое когда-то дали мальчику, названному в честь святого Алексия.