Фамилия Альгайер — редкий для России пример немецкой фамилии-ориентира. Её не выводили из ремесла или внешности предка, а дали по месту, откуда он пришёл. Основа восходит к слову Allgäu — названию исторической области на юго-западе Баварии, в предгорьях Альп. Альгайер (Allgäuer) буквально означает «выходец из Альгоя», как шваб, баварец или тиролец. Фамилию образовали по стандартной немецкой модели: название местности плюс суффикс -er, указывающий на принадлежность человека к этой территории.

Слово Allgäu имеет непростую этимологию. Первая часть, по одной из версий, восходит к древневерхненемецкому ala (весь, полностью), вторая — к gawi (область, край). Сложившись, они могли означать «целая область» или «вся территория» — исторический намёк на самостоятельное владение. Носитель фамилии Альгайер — это «человек из Альгоя», то есть тот, кто переселился оттуда в другую местность и получил прозвище по прежнему дому.

В России фамилия встречается крайне редко и почти исключительно среди потомков немецких колонистов, которых Екатерина II пригласила в XVIII–XIX веках. Переселенцы из Швабии и Баварии, включая уроженцев Альгоя, основывали колонии в Поволжье, Причерноморье и на Волыни. Фамилия могла закрепиться в форме Альгайер, хотя в немецком написании она чаще выглядит как Allgäuer — с умлаутом. В русских документах умлаут, как правило, исчезал, и фамилию записывали на слух: Альгайер, реже Альгауэр.

С точки зрения словообразовательной модели, Альгайер стоит в одном ряду с такими немецкими фамилиями, как Швайгер (из Швабии), Байер (из Баварии) или Сакс (из Саксонии). Это не ремесленная и не описательная фамилия, а чисто географический идентификатор. Она говорит о том, что предок носителя был переселенцем, сохранившим в фамилии память о своей родине — альпийском регионе с лугами, сыроварнями и горными озёрами.