Фамилия Альгужин — редкая и звучит не по-русски. Её основа, суффикс и география бытования указывают на тюркское происхождение, скорее всего, башкирское или татарское. Встречается она преимущественно в Башкортостане и соседних регионах Урала, что сразу подсказывает направление поиска.

В центре фамилии лежит имя или прозвище Альгужа. Это сложное слово, которое можно разобрать на две части: «ал» (башк. «ал» — возьми, бери, либо «ал» — алый, красный, передний) и «гуж/гужа». Вторая часть — загадочнее. В башкирском языке «гужа» (күжә) — это «кожа», «шкура», а в переносном смысле — «оболочка», «мешок». Есть и другая версия: «гуж» может восходить к тюркскому «күҙ» — «глаз», но тогда форма была бы иной.

Самая правдоподобная версия: Альгужа — это прозвище, данное человеку по цвету или качеству кожи («ал» — алый + «гужа» — кожа, то есть «краснокожий»), либо по действию («возьми кожу» — прозвище кожевника). Кожевенное ремесло было широко распространено у башкир и татар, и прозвища по роду занятий — частый источник фамилий.

Суффикс -ин указывает на форму «чей?»: Альгужин — «сын Альгужи». В русской традиции так оформляли фамилии от основ, оканчивающихся на -а, -я. Это типичная модель для тюркских фамилий, которые русифицировали в XIX–XX веках при записи в метрики и переписи.

Таким образом, предок носителя фамилии Альгужин, скорее всего, был башкиром или татарином, жившим на Южном Урале, и получил прозвище по внешнему признаку (смуглая или красноватая кожа) или по ремеслу кожевника. Фамилия недворянская, крестьянско-мещанская, что подтверждается её отсутствием в дореволюционных родословных книгах.