Фамилия Алидин — редкая, и её происхождение неочевидно. Внешне она похожа на множество русских фамилий на -ин, образованных от имён и прозвищ, но её основа не укладывается в привычный ряд Иванов, Петров или Сидоров.

Скорее всего, перед нами нестандартная фамилия, возникшая из личного имени Алид. Такое имя могло быть как каноническим (крестильным), так и мирским. В православных святцах имени Алид нет, но оно могло попасть в русский обиход через посредничество греческого языка: например, как сокращённая форма от имени Алипий (греч. «беспечальный») или Алексид (от Алексий, «защитник»). В народной среде длинные имена часто усекали, и Алид — вполне возможный результат такого сокращения. Тогда Алидин означает «потомок Алида» (сын, внук или человек из его рода).

Вторая версия — происхождение от прозвища. В некоторых русских говорах слово «алид» могло быть искажением или диалектным вариантом слова «алик» — так в ряде областей называли задиристого, озорного человека (ср. «аликоватый» — взбалмошный). Если это так, фамилия закрепилась за родоначальником, получившим такое прозвище за характер.

Нельзя исключать и более экзотический путь: фамилия могла возникнуть в среде крещёных татар или других тюркских народов. Имя Алид (Алит) встречается у мусульман как производное от Али («возвышенный»). В таком случае носитель фамилии — потомок человека по имени Алид, а сама фамилия — результат адаптации тюркского антропонима к русской модели на -ин.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и югу России — регионам, где исторически смешивались русское и тюркское население. Встречается она редко, сословного барьера не имела: её могли носить и крестьяне, и мещане. Из-за редкости фамилия не обросла громкими именами в истории, что, впрочем, не мешает ей быть точным маркером своего корня — какого бы происхождения он ни был.