Фамилия Алилов образована от арабского мужского имени Алил, которое на русский язык переводится как «мудрый, знающий». Родители, нарекая ребенка таким именем, желали ему стать образованным и эрудированным человеком. Однако само имя Алил встречается реже, чем его «старший брат» Али, и это накладывает отпечаток на всю фамилию: она не столь распространена, как, скажем, Алиев.

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна: к основе Алил- добавился русский патронимический суффикс -ов, который в русском языке закрепился за фамилиями нерусского происхождения. По сути, Алилов — это «сын Алила». Подобная модель образования типична для многих фамилий народов Кавказа и Поволжья, где арабские имена легли в основу русских по форме фамилий.

В ономастике иногда встречается и другая версия: что фамилия могла возникнуть от прозвища, данного человеку с мягким, «тихим» характером (от тюркского «алил» — тихий, спокойный). Но эта гипотеза уступает первой по правдоподобию, так как арабское имя Алил имеет устойчивую письменную традицию, а тюркские аналоги редки и не зафиксированы в словарях личных имен.

Географически фамилия Алилов тяготеет к Дагестану, где распространены арабские имена в национальных формах. Встречается она и у чеченцев, и у народов Центральной Азии, но везде сохраняет связь с исходным значением имени — «мудрый».