Фамилия Алилова — женская форма от Алилов, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель на -ов/-ев типична для русских фамилий, образованных от прозвищ или мирских имён, но здесь основа не славянская, а тюркская или кавказская. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Алила» или «из рода Алила». Само имя Алил — это, скорее всего, вариант имени Али, распространённого у народов, исповедующих ислам. Али — арабское имя, означающее «возвышенный», «великий». В тюркских языках к нему мог добавиться ласкательный или уменьшительный аффикс -ил, что дало форму Алил: «маленький Али», «Али-младший».

Географически фамилия Алилов и, соответственно, Алилова чаще всего встречается среди народов Северного Кавказа — у кумыков, лезгин, аварцев, а также у татар и башкир. В русском контексте она могла появиться при крещении или переходе в православие, когда тюркское или горское прозвище фиксировалось в документах с русским патронимическим суффиксом. Однако не исключено, что основа восходит не к имени, а к прозвищу. В некоторых тюркских диалектах «алил» могло означать «хитрец», «ловкач» или «шалун» — тогда фамилия отражает не родство, а характер предка.

Вторая, менее вероятная версия: Алил — это искажённое Али-улла («величие Аллаха»), но для фамилии такая конструкция нетипична. Ономастика здесь склоняется к простому объяснению: уменьшительное от Али. Фамилия Алилова не имеет отношения к дворянским родам — это фамилия крестьянская или мещанская, в основном из регионов с сильным тюркским влиянием. Встречается она редко, и в дореволюционных метриках её носителей стоит искать в Астраханской губернии, на Кавказе и в Поволжье. Известных общественных деятелей с этой фамилией нет, поэтому её ценность — в бытовой истории: за ней стоит конкретный человек, которого в своём селе звали Алилом.