Фамилия Алипкин — не книжная, а живая, народная. Её основа — слово «алип», которое в южнорусских говорах означало «арап», «чернокожий», а также, по Далю, бранно: «бес, дьявол» или «обманщик», «плут». Так прозвали либо человека с очень смуглой кожей и тёмными волосами — что было редкостью для средней полосы, — либо того, кого считали хитрецом и пройдохой. В некоторых говорах «Алипкой» могли назвать и кривляку, паяца, подражавшего, как тогда говорили, «арапскому» поведению.

Суффикс «-кин» работает по простой модели: сначала появилось прозвище Алипка (уменьшительно-уничижительная форма от «алип»), а затем от него — притяжательная форма «чей?» — то есть «сын Алипки». Это типичный русский способ образования фамилий от прозвищ, оканчивающихся на согласный.

У фамилии чёткая географическая привязка. По данным переписей и метрических книг XVIII–XIX веков, Алипкины встречаются преимущественно в Курской, Орловской и Воронежской губерниях, а также в некоторых уездах Тамбовщины. Это регионы, где было сильно влияние южнорусских говоров и где слово «алип» бытовало в крестьянской среде. Встречаются варианты написания Алепкин и Аляпкин — скорее всего, диалектные искажения или ошибки записей.

Сословный состав носителей — преимущественно крестьянский и однодворческий. Алипкины не принадлежали к дворянству; это фамилия людей, которые пахали землю, служили по рекрутским наборам или занимались мелкой торговлей. В Курской губернии фамилия нередко возникала как «уличное» прозвище, которое затем попадало в официальные бумаги при ревизиях. Её носители — потомки тех, кого в деревне когда-то прозвали «алипом» за смуглость или за хитрость, и это прозвище стало их родовым знаком.