Фамилия Алипкачева — женская форма фамилии Алипкачев, а та, скорее всего, образована от прозвища или имени Алипкач. Словообразовательная модель здесь редкая и неочевидная: суффикс «-ев» указывает на принадлежность («чей?»), но основа не укладывается в привычные славянские формы. В русских фамилиях суффикс «-кач» встречается редко и обычно связан с тюркскими или кавказскими языками, где он мог означать уменьшительность или профессию.

Самый вероятный корень — тюркское имя Алип, которое восходит к арабскому «алиф» (первый) или тюркскому «алып» (богатырь, герой). В татарской, башкирской, кумыкской среде «Алып» — это эпический персонаж, великан или воин. Формант «-кач» мог быть диалектным вариантом уменьшительного суффикса (ср. татарское «-кай», «-кэч»), то есть Алипкач — это «маленький Алип» или «сын Алипа». Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с адыгским или черкесским словом «алип» (благородный) и суффиксом «-каче» (сын), но тогда фамилия звучала бы как Алипкаче, без удвоения «к» в русской записи.

Географически фамилия Алипкачев встречается в Дагестане, Чечне и у татар, что подтверждает её северокавказское или волго-уральское происхождение. В русских документах XIX века такие фамилии часто записывали через «-ев», а не «-ов», так как основа оканчивалась на мягкий согласный или шипящий. Предки носительницы фамилии могли быть из среды кумыкских или татарских крестьян, ремесленников или воинов, но сословной привязки нет — фамилия не указывает на дворянство или духовенство.

В написании «Алипкачева» обращает на себя внимание буква «ч»: в тюркских языках она часто передаёт звук, близкий к «дж», но в русской транскрипции закрепился именно твёрдый «ч». Если бы фамилия записывалась с «дж», она могла бы выглядеть как Алипкаджева, но историческая запись пошла по пути минимального упрощения.