Фамилия Алипкачева — женская форма от Алипкачев, и чтобы понять её корни, нужно разобрать мужскую основу. Она образована от прозвища или имени Алипкач, где суффикс «-ев» работает по привычной модели принадлежности («чей?»), но сама основа Алипкач для русского уха звучит необычно. Дело в том, что суффикс «-кач» в русских фамилиях — редкость; он почти всегда указывает на тюркское или кавказское происхождение, где мог означать уменьшительность или род занятий.

Самый вероятный корень — тюркское имя Алип, которое восходит либо к арабскому «алиф» (первый), либо к тюркскому «алып» (богатырь, герой). В татарской, башкирской и кумыкской традиции «Алып» — это эпический персонаж, великан или воин. Формант «-кач» здесь, скорее всего, диалектный вариант уменьшительного суффикса (сравните с татарским «-кай» или «-кэч»). То есть Алипкач — это «маленький Алип» или «сын Алипа». Есть и вторая версия, менее распространённая: она связывает фамилию с адыгским или черкесским словом «алип» (благородный) и суффиксом «-каче» (сын). Но тогда в русской записи фамилия звучала бы как Алипкаче, без удвоения «к», а у нас — Алипкачев, что делает первую версию убедительнее.

География фамилии подтверждает её северокавказское или волго-уральское происхождение: Алипкачевы встречаются в Дагестане, Чечне и у татар. В русских документах XIX века такие фамилии часто записывали через «-ев», а не «-ов», потому что основа оканчивалась на мягкий согласный или шипящий. Предки носительницы фамилии могли быть кумыкскими или татарскими крестьянами, ремесленниками или воинами, но сословной привязки здесь нет — фамилия не указывает ни на дворянство, ни на духовенство.

В написании «Алипкачева» обращает на себя внимание буква «ч». В тюркских языках она часто передаёт звук, близкий к «дж», но в русской транскрипции закрепился именно твёрдый «ч». Если бы фамилия записывалась с «дж», она могла бы выглядеть как Алипкаджева, но историческая запись пошла по пути минимального упрощения.