Фамилия Аливагабов — яркий пример того, как в одной фамилии может сочетаться несколько языковых и культурных слоев. Ее основа — составное личное имя Али-Вагаб, где первая часть (Али) — арабского происхождения, означает «возвышенный», «великий». Вторая часть, Вагаб, восходит к арабскому имени Ваххаб (или Ваххаб) — «дарующий», «щедрый». Оба имени популярны у мусульманских народов, особенно у азербайджанцев и дагестанцев. Соединение двух имен в одно (Аливагаб) — распространенный в Закавказье и на Кавказе способ образования сложного имени, подчеркивающего благочестие или пожелание ребенку качеств обоих носителей.

Формант -ов в конце фамилии — типичный русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность («сын Аливагаба»). Такая модель закреплялась в XIX–XX веках, когда народы Кавказа и Закавказья, входившие в состав Российской империи, получали официальные фамилии по русскому образцу. То есть фамилия Аливагабов — это русифицированная форма отчества, произведенного от личного имени Аливагаб. Она не несет сословной нагрузки: ее могли получить и крестьяне, и горожане, и представители духовенства.

Этимологически фамилия тесно связана с арабо-исламской культурой, но географически распространена в регионах, где говорят на тюркских и кавказских языках. Встречается у азербайджанцев, лезгин, табасаранцев и других народов Дагестана. В русском языке фамилия сохраняет ударение на последнем слоге: Аливага́бов.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Алиев, Вагабов, Алиагаев) показывает, что Аливагабов — более редкая и поздняя по форме модель. В ней закрепилось не одно имя, а целая конструкция, что делает фамилию своеобразным документом, фиксирующим традицию давать ребенку двойное имя с религиозным смыслом.