Фамилия Аливанова — женская форма, образованная от мужской Аливанов. Её основа — имя или прозвище Аливан. Прямого отношения к арабскому имени Али («возвышенный») здесь нет, хотя внешнее сходство часто вводит в заблуждение.

Вероятнее всего, Аливан — это редкая русская народная форма крестильного имени Иван. В говорах, особенно на юге России и в Поволжье, начальное «И» переходило в «А»: Иван — Аван, Илья — Алья. Аливан — «местный» вариант, где к основе добавился суффикс -ан, характерный для обиходных, уменьшительно-ласкательных имён (как Степан от Стефан или Федотан от Фёдор). Суффикс -ов указывает на принадлежность: Аливанов значит «сын Аливана». Модель типична для русских фамилий XVI–XVII веков, когда отчества на -ов закреплялись за крестьянскими и посадскими семьями. Поскольку Иван было самым распространённым именем на Руси, его производные дали огромное количество фамилий (Иванов, Ванин, Ваньков), но Аливанов встречается реже — это говорит о том, что форма Аливан бытовала в ограниченном ареале, скорее всего, в южнорусских или средневолжских говорах.

Менее вероятная версия — связь с тюркским именем Аливан (от арабского «алим» — учёный, знающий). В таком случае фамилия могла возникнуть у татар, башкир или других народов, где имя Аливан встречается как самостоятельное. Однако русская огласовка и суффикс -ов типичны именно для славянской модели, поэтому версия с народной формой Ивана убедительнее.

География фамилии Аливанова сегодня размыта: носители встречаются и в русских областях (Рязанская, Тамбовская), и в регионах с тюркским населением. Это как раз подтверждает возможность двух разных корней — славянского и тюркского, которые сошлись в одной фамильной форме.