Фамилия Альхатом — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение напрямую связано с арабским миром. В основе лежит арабское слово «аль-хаким» (الحكيم), означающее «мудрый», «врач» или «правитель». Трансформация в «Альхатом» — результат адаптации арабского звучания к русской фонетике и графике: конечное «им» перешло в «ом» под влиянием твёрдого произношения, а буква «к» могла озвончиться или перейти в «т» из-за особенностей диалектного произношения носителей. Таким образом, фамилия не является исконно русской — она появилась в среде, где русский язык контактировал с арабским, прежде всего на Кавказе, в Средней Азии или в Поволжье среди татар и башкир, исповедующих ислам.

Словообразовательная модель здесь нестандартна для русских фамилий. В ней отсутствуют типичные суффиксы (-ов, -ин, -ский), что указывает на то, что фамилия заимствована целиком как прозвище или личное имя, а затем закрепилась в качестве родового имени без дополнительной русификации. Предок носителя фамилии, скорее всего, был человеком, которого в общине называли «аль-хаким» — то есть мудрецом, знахарем или уважаемым судьёй. В исламской традиции это почётное прозвание, которое могли дать и потомкам пророка Мухаммеда (сеидам), и просто образованному или врачевавшему человеку.

Встречается фамилия крайне редко, в основном в южных регионах России (Дагестан, Чечня) и в среде татарской диаспоры. Из-за редкости и специфического корня её часто путают с фамилией Альхимович (белорусского происхождения) или считают вариантом фамилии Альхамов, но это разные линии. Фамилия Альхатом — яркий пример того, как арабское культурное наследие через исламскую традицию вошло в русский быт, оставив след в виде личного прозвания, ставшего фамилией.