Фамилия Алонова — женская форма от Алонов, и её происхождение упирается в загадочную основу «Алон». Суффикс -ов/-ев в русской традиции указывает на принадлежность: Алонов буквально значит «сын Алона». Вопрос в том, кем был этот Алон.

Здесь возможны два пути, и расходятся они в разные эпохи. Первый, самый прямой: Алон — это редкое календарное имя. В святцах его нет, но в дореволюционных метрических книгах встречаются единичные случаи крещения с именем Алон. Скорее всего, это народная переделка какого-то церковного имени — например, Аполлон или Алоний. Если так, то Алоновы — потомки человека, которого в быту звали Алоном.

Вторая версия — прозвищная, и она выглядит убедительнее. В южнорусских и украинских говорах «алонь» или «алон» означало «олень». Это диалектное слово зафиксировано в курских и воронежских говорах. Прозвище Алон могли дать быстрому, стройному или пугливому человеку — по ассоциации с оленем. В таком случае фамилия Алонов встаёт в один ряд с типичными «животными» прозвищами вроде Волкова, Зайцева или Медведева.

География фамилии косвенно поддерживает прозвищную версию. Алоновы (и Алоновы) встречаются рассеянно, без ярко выраженного гнезда, но чаще всего — в центральных и южных областях России. Встречаются они и среди донских казаков, где прозвищные фамилии особенно распространены. Есть и раннее документальное свидетельство: в актах Воронежского уезда за 1629 год упоминается крестьянин Афонька Алонов. Это одна из самых старых записей фамилии.

Так что Алонова — фамилия с неочевидным, но живым корнем. Обе версии правдоподобны, но прозвищная — «оленья» — подкрепляется и географией, и ранними записями.