Фамилия Алсейтова — женская форма фамилии Алсейтов, а та, в свою очередь, образована от мужского личного имени Алсейт. Это имя — результат тюркского слияния двух основ: «ал» (красный, алый) и «сейт» (господин, предводитель, арабское سيد — саййид). Получается «алый господин» или «красный предводитель» — прозвище, которое могло указывать либо на внешность (рыжеватый или румяный человек), либо на высокий социальный статус носителя, подчёркнутый яркой, «цветной» характеристикой.

По модели образования фамилия относится к самому массовому типу — патронимическому. Суффикс -ов (в женском варианте -ова) присоединился к основе Алсейт, чтобы ответить на вопрос «чей сын?»: сын Алсейта — Алсейтов. Такая схема характерна для русской фамильной традиции, но основа здесь явно заимствована из тюркских языков, что типично для Поволжья, Приуралья и Северного Кавказа, где веками жили татары, башкиры, казахи и ногайцы, принимавшие русское делопроизводство и фамильные окончания.

Географически фамилия Алсейтова встречается в основном в Оренбургской области, Башкортостане и Челябинской области — регионах с плотным татаро-башкирским населением. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках можно найти записи об Алсейтовых среди государственных крестьян и тептярей (сословие, платившее ясак). Встречается и вариант написания с одной «т» — Алсеитов, что объясняется нестабильностью фиксации тюркских имён в русских канцеляриях XIX века.

Редкость фамилии (она не входит в первые тысячи по частотности) говорит о том, что родоначальник был заметной, но локальной фигурой — возможно, деревенским старшиной или зажиточным скотоводом, чьё прозвище закрепилось за потомками в одном-двух селениях. В отличие от массовых фамилий на -ин или -ский, Алсейтовы сохранили прямую связь с конкретным личным именем, почти не изменив его звучания.