Фамилия Алшынов — редкий случай, когда происхождение почти наверняка лежит не в славянской, а в тюркской языковой среде. Суффикс -ов указывает на русскую модель оформления фамилии (притяжательное значение «чей?»), но основа Алшын — это, скорее всего, адаптированное тюркское имя или этноним.

Самая прямая версия: основа восходит к тюркскому имени Алшын (или Алчин). В казахском, башкирском и других тюркских языках имя Алшын могло означать «отважный», «смелый», либо связываться с понятием «первый» (ал — перед, начало). У башкир, например, известно родоплеменное подразделение алшын. Таким образом, прозвище Алшын мог получить человек, отличавшийся храбростью, или же тот, кто происходил из соответствующего рода. Фамилия Алшынов буквально значит «потомок Алшына».

Вторая, менее вероятная версия — связь с арабским именем Альшан (возможный вариант передачи имени Хасан или схожих корней), но это потребовало бы сложного фонетического перехода и не подкрепляется типичной тюркской ономастикой.

Географически фамилия Алшынов тяготеет к регионам с тюркским населением: Оренбургская область, Башкортостан, Татарстан, Казахстан. В русских переписных книгах XVI–XVII веков она не встречается — это более поздняя, «окраинная» фамилия, которая оформилась в среде, где тюркские имена русифицировались через стандартный суффикс -ов.

Интересная деталь: в отличие от фамилий на -ин (от основ на -а/-я), форма Алшынов показывает, что исходное имя Алшын воспринималось как основа на твердый согласный, что типично для тюркских заимствований. Если бы имя звучало как Алша, мы бы получили Алшин. Разница в одну букву — и модель образования меняется.