Фамилия Алубаев — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять, откуда она взялась, стоит в первую очередь взглянуть на окончание. Суффикс -ев указывает на русскую модель образования от имени или прозвища, оканчивающегося на согласный или на -а/-я. В данном случае основа — Алубай.

Самая вероятная версия — тюркское происхождение. В казахском, башкирском, татарском и других тюркских языках имя Алубай (или Алыбай) составное: первая часть «алу» или «алы» может означать «взять», «брать», «сила», «могущество» (ср. казахское алу — брать, алып — богатырь, гигант), а вторая — «бай» — традиционный компонент тюркских имён со значением «господин», «богач», «хозяин». Таким образом, имя Алубай могло означать «сильный господин», «взятый (богом) хозяин» или «богатырь-владелец». Встречается и вариант толкования от «ал» (красный, алый), но он менее убедителен для личного имени.

Вторая, менее распространённая гипотеза, отсылает к арабскому корню. Имя Алу может быть сокращением от Али (высокий, возвышенный) или от Алу- (семья, род, как в «Алу-бейт» — люди дома Пророка). Но тогда форма «Алубай» выглядит как искусственное слияние, нехарактерное для арабской ономастики, поэтому тюркская версия выглядит предпочтительнее.

Географически фамилия Алубаев встречается преимущественно в регионах с тюркским населением: в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской области, а также у казахов. Встречаются и варианты написания — Алыбаев, Алабаев. Последний, кстати, имеет параллельное значение: у тюркских народов «алабай» — это порода крупной сторожевой собаки (среднеазиатская овчарка), и фамилия могла возникнуть как прозвище по внешнему сходству или роду занятий (сторож, пастух). Но в случае с Алубаевым основа всё же ближе к личному имени.

По социальному происхождению носители фамилии, скорее всего, относились к крестьянам или служилым людям (казакам, ямщикам) в Поволжье и Приуралье. Фамилии на -ев у тюркских народов стали массово фиксироваться в XVIII–XIX веках, когда их записывали в метрические книги по русскому образцу. Так что предок Алубаевых, носивший имя Алубай, был, вероятно, обычным сельским жителем — башкиром, татарином или казахом, чьё имя просто русифицировали при оформлении документов.