Фамилия Алубаев — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы в этом разобраться, стоит начать с её формы. Суффикс -ев — верный признак русской модели образования от имени или прозвища, оканчивающегося на согласный или на -а/-я. Основа здесь — Алубай.

Самая убедительная версия — тюркская. В казахском, башкирском, татарском и других тюркских языках имя Алубай (или Алыбай) составное: первая часть «алу» или «алы» означает «брать», «сила», «могущество» (ср. казахское алу — брать, алып — богатырь), а вторая — «бай» — «господин», «богач», «хозяин». Следовательно, имя Алубай могло означать «сильный господин», «богатырь-владелец» или «взятый (богом) хозяин». Вариант толкования от «ал» (красный, алый) для личного имени менее убедителен.

Вторая гипотеза, менее распространённая, отсылает к арабскому корню: Алу может быть сокращением от Али (высокий) или частью «Алу-» (семья, род, как в «Алу-бейт»). Но слияние «Алубай» для арабской ономастики нетипично, поэтому тюркская версия предпочтительнее.

Географически фамилия встречается преимущественно в регионах с тюркским населением: в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской области, а также у казахов. Варианты написания — Алыбаев, Алабаев. Последний интересен отдельно: у тюркских народов «алабай» — порода крупной сторожевой собаки (среднеазиатская овчарка); фамилия могла возникнуть как прозвище по внешнему сходству или роду занятий (сторож, пастух). Но в случае с Алубаевым основа всё же ближе к личному имени.

По социальному происхождению носители фамилии, скорее всего, относились к крестьянам или служилым людям (казакам, ямщикам) в Поволжье и Приуралье. Фамилии на -ев у тюркских народов массово фиксировали в XVIII–XIX веках, когда их записывали в метрические книги по русскому образцу. Предок Алубаевых, носивший имя Алубай, был, вероятно, обычным сельским жителем — башкиром, татарином или казахом, чьё имя просто русифицировали при оформлении документов.