Фамилия Алякаева — женская форма, а её мужской вариант Алякаев образован от прозвища или имени Алякай. В основе лежит тюркское имя Алякай (или Аляка), которое восходит к арабскому «али» (высокий, возвышенный) с уменьшительно-ласкательным суффиксом -кай. У татар и башкир такие имена были в ходу: Алякай могло означать «маленький высокий» или служить ласковым обращением к человеку по имени Али.

Суффикс -ев в фамилии Алякаев — типичный русский патронимический формант, который присоединяли к основам на -ай или -ей. Получается, Алякаев — это «сын Алякая». Фамилия не дворянская: она возникла в крестьянской или мещанской среде, скорее всего, в Поволжье, Приуралье или на юге Урала — регионах с сильным татарским или башкирским влиянием. Многие русские фамилии с тюркскими корнями появились в XV–XVII веках, когда русские крестьяне и служилые люди контактировали с тюркоязычным населением, и прозвища переходили в фамилии.

Алякаева — фамилия редкая, и её написание устойчиво, без вариантов вроде Алякаева или Алякаева. Если сравнить с однокоренными Алякин или Аляев, то Алякаев выделяется именно тюркским суффиксом -кай, который редко сохраняется в русских фамилиях. Это намекает, что носители могли долго держаться за исходное тюркское имя, а не русифицировать его до Али или Аля.

В современных источниках фамилия фиксируется в Татарстане, Башкортостане и Оренбургской области — там, где исторически жили тюркоязычные народы. Полной уверенности, что все носители — потомки татар или башкир, нет: фамилия могла закрепиться и у русских, перенявших прозвище от соседей. Но корень у неё однозначно тюркский, и предки, скорее всего, были людьми, которых звали Алякай — возможно, невысокого роста или с именем Али в основе.