Фамилия Алюхановы образована от восточного мужского имени Алихан. Это составное имя: первая часть «али» в переводе с арабского означает «самый сильный», «мощный», «великий» или «знаменитый». Вторая часть — «хан», древний тюркский титул, который первоначально обозначал вождя племени у кочевников Ирана и Афганистана. Чередование гласных «и/ю» в корне (Алихан → Алюхан) — результат исторических процессов, происходивших в языке при адаптации имени.

Своими корнями фамилия уходит в XV–XVII века. В этот период многие выходцы из Золотой Орды, печенегов и половцев переходили на службу к русским князьям, пополняя ряды служилого дворянства. Проникновению тюркских основ в русские фамилии способствовал тот факт, что значительная часть дворян в России была нерусского происхождения. Сведения о восточных корнях родоначальника Алюхановых подтверждаются самим именем — Алихан, которое было широко распространено в тюркоязычной среде.

В русском языке фамилия закрепилась в форме притяжательного прилагательного с суффиксом -ов, что типично для фамилий, образованных от личных имён. Встречается также вариант написания через «а» — Алиханов, но форма Алюханов фиксирует более ранний этап адаптации, когда имя уже произносилось на русский лад. Географически фамилия чаще всего встречается в регионах Поволжья и Южного Урала, где исторически было сильное татарское и башкирское влияние.

Фамилия Алюхановы — памятник восточной письменности и культуры, сохранивший в своей основе арабское имя и тюркский титул. Она не говорит о конкретном ремесле или прозвище предка, но прямо указывает на его имя, которое в свою очередь несло значение силы и знатности.