Фамилия Алюскина — редкий случай, когда географическая привязка оказывается надёжнее морфологического разбора. Суффикс -ин указывает на принадлежность «сын Алюски» или «из дома Алюскиных», а вот основа ставит перед выбором.

Самая вероятная версия — топонимическая. Фамилия могла возникнуть от названия населённого пункта Алюскино или Алюска. Такие названия встречаются в центральной России, особенно в бывших владениях, где была распространена модель образования селений по фамилии владельца с суффиксом -ск. В этом случае Алюскин — тот, кто родом из Алюска или Алюскино. Переселенцы, записываясь на новом месте, нередко получали фамилию по покинутой деревне, и суффикс -ин закрепил форму притяжательности.

Вторая версия — от прозвища или неканонического имени Алюска. В русских говорах слово «алюс» или «алюска» могло означать нечто небольшое, юркое или, наоборот, чудаковатое. Прямых словарных фиксаций у этого корня нет, но в ономастике нередки фамилии от местных диалектизмов, не попавших в литературный язык. Менее вероятна связь с тюркским «алю» (брать, хватать) — для фамилии на -ин такая основа нетипична, хотя в зонах смешанного населения исключать её полностью нельзя.

С точки зрения социального контекста, Алюскины — почти наверняка крестьянский или мещанский род. Дворянские фамилии на -ин оформлялись иначе (через -ов/-ев или с иной географией). Если фамилия действительно пошла от названия деревни, то предки были либо крепостными, либо государственными крестьянами, которых переселили в другую губернию и записали по старому месту жительства.

Сейчас фамилия встречается крайне редко, преимущественно в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает версию о переселенческом прошлом. Разобрать её до конца без конкретных архивных записей не получится, но направление поиска ясное: ищите деревни с корнем «Алюс» в писцовых книгах XVII–XVIII веков.